张庆是一名大学生，最近他一直在寻找用现代观念剖析古代文学史的方法，而他的老师却觉得他这种想法是错的。为了证明自己的方法是正确的，张庆打算参加一个科幻文学网络大赛，他想用写一个拥有现代思维的人在古代的生存之道。就连不看好他的老师也被他的这个脑洞所吸引。张庆坐在桌边想了很久，他决定将他的小说命名为《庆余年》。
一个患有重症肌无力的现代青年，睁眼醒来，却成了竹筐里的婴儿，脑海还保留了现代社会的一切记忆，却有古装杀手围攻追杀。原来这个竹筐里的婴儿正是张庆小说里的主角范闲，而背着他杀出重围的瞎子，名为五竹，是范闲亡母的仆人。
五竹背着范闲逃避追杀来到了悬崖边，带着黑骑赶来的南庆监察院院长陈萍萍坐着轮椅与五竹见面，得知小姐也就是范闲的母亲已经死了，他悲痛欲绝，想带范闲回去。但五竹觉得范闲与陈萍萍回去会有危险，于是他听从了陈萍萍的建议，将范闲带到了儋州，由老太太抚养长大。
几年过去了，范闲长成了一名小少年，但他举止说话俨然不是一个小孩的样子，范府的周管家只当他是有点早熟。和范闲一起长大的女孩是范府嫡出的大小姐范若若，两人感情一直很好，但若若不久就要被带去京都了，这让范闲很难过。
范闲是范大人的私生子，不能在京城去生活，只配留在老太太身边，但老太太对他也不冷不热，有时候周管家刁难范闲，老太太也不会多说什么。好在范闲思想成熟，他见不惯的自己动手，有一次周管家责罚丫鬟，他便狠狠地打了周管家一巴掌。
夜里，范闲正在睡觉，一个黑衣人突然飞进了他的房间，不过他竟然机智地将对方打晕了。原来此人是京都鉴查院第三处的主办费介。当范闲将此事告诉给五竹叔叔时，五竹告诉范闲费介是自己人，范闲这才反应过来自己打错人了。
费介醒后拜见了老太太，并告诉她自己是范大人安排过来做范闲师父的。就这样，费介成了范闲师父，教他行医识毒。
还好范闲是一个小大人，费介不着调的作风在范闲看来都很自然。费介不仅教范闲解剖尸体，还总爱给范闲下毒。范闲中毒中习惯了，也就无所谓了。
费介告诉范闲，如果哪天他让自己中毒了，他也就出师了。与此同时，五竹给了范闲一本内功心法，偶尔也会教范闲练习运用真气。在五竹的教导下，范闲学会了被人打的时候还手以及逃命。
时光飞逝，几年后范闲学有所成，成功让费介中毒后出师。费介因此准备回京，临行前范闲依依不舍，费介给了他一枚检察院提司的腰牌，告诉他以后有事可以找自己。
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